سی پنل یکی از امن ترین کنترل پنل ها می‌باشد ، اما مانند هر برنامه تحت وب دیگر ممکن است در صورت عدم رعایت موارد امنیتی سایت شما با مشکل مواجه گردد. لذا همیشه تمهیدات امنیتی مربوط به سایت و پنل خود را به روز نگه دارید.